Kolor oczu to kolor tęczówki, kolorowej części otaczającej źrenicę (mała czarna plamka w środku oka). Ciekawostką jest, że każdy człowiek ma niepowtarzalny kolor oczu, podobnie jak odciski palców.

Najczęściej występującym kolorem oczu jest brązowy, a także niebieski, zielony i orzechowy. Dodatkowo tęczówka może mieć kolor mieszany, np. brązowy z żółtym, brązowy z zielonym lub brązowy z niebieskim.
Tęczówka znajduje się wewnątrz oka, pod przezroczystą, bezbarwną warstwą zwaną rogówką, która ma grubość mniejszą niż pół milimetra. Tęczówka składa się z wielu komórek, specjalnych mięśni, naczyń krwionośnych i nerwów. Tęczówkę otacza śluzowata substancja złożona z milionów maleńkich włókienek krzyżujących się ze sobą.
Organizm człowieka wytwarza wyłącznie brązowy pigment tęczówki (melaninę), nie produkuje natomiast niebieskiego, zielonego ani orzechowego pigmentu.
Komórki barwnikowe tęczówki zawierają melanosomy. Wszystkie kolory tęczówki mają tę samą liczbę komórek pigmentowych, ale granulki pigmentu wewnątrz komórek są różne. Na przykład brązowe tęczówki mają więcej granulek pigmentu niż niebieskie tęczówki.
Inne komórki tęczówki wytwarzają w tęczówce drobne włókna i śluz, które pomagają chronić tęczówkę przed uszkodzeniami. Źrenica może się kurczyć i rozszerzać dzięki specjalnym mięśniom tęczówki wyposażonym w włókna elastyczne.
Tylna część tęczówki to ciemna powierzchnia z komórkami wypełnionymi tylnym pigmentem powierzchniowym, który pomaga zapobiegać rozpraszaniu się światła przez tęczówkę, co korzystnie wpływa na widzenie.
Białe światło zawiera tęczowe spektrum kolorów od niebieskiego do czerwonego. Kiedy światło przechodzi przez tęczówkę, niebieskie światło rozprasza się bardziej niż inne kolory i zostaje odbite. Jeśli natomiast granulek pigmentu będzie mniej, tęczówka będzie niebieska.
Inne kolory światła, zwłaszcza czerwony, ulegają mniejszemu rozpraszaniu i dostają się do tęczówki pomiędzy włókna, śluz i komórki. Dlatego zielone, orzechowe i brązowe oczy mają więcej tego pochłaniającego światło pigmentu.
Tak więc jest to wynik tego, że niektóre kolory rozpraszają więcej lub mniej światła niż inne, a brązowe cząsteczki pigmentu pochłaniają więcej niektórych kolorów. Liczba cząsteczek pigmentu decyduje o kolorze oczu danej osoby.

Kolor tęczówki nie pozostaje taki sam przez całe życie, ale może się zmieniać pod wpływem ciemnego pigmentu produkowanego w komórkach tęczówki po urodzeniu. Na przykład noworodek o niebieskich oczach może zmienić kolor na brązowy lub orzechowy już w ciągu pierwszego dnia życia.
Niektóre choroby i urazy mogą również powodować zmianę koloru tęczówki.
Niektórzy ludzie rodzą się z jednym brązowym i jednym niebieskim okiem i to nigdy się nie zmienia przez całe ich życie. Przyczyna tego zjawiska nadal nie jest znana.